계약서는 이해당사자들간의 의무와 권리를 서류화 한것입니다.

계약기간중 계약 조건을 변경할 수 있으며, 이런 상황에서는 계약서를 새로이 작성하는 것이 보편적이고 안전합니다.

2번은 고려하지 않으셔도 될 것으로 생각됩니다.

질문자님께서 정 불안하시다면 확정일자를 다시 받으시는 것을 추천드립니다.