식도나 위장관에 이소성 치아나 이종골화증이 생기면 주로 물리적 폐쇄나 염증, 궤양으로 인한 증상이 나타납니다. 대표적으로 음식 삼킴 곤란, 삼킬 때 통증, 식도 내 이물감, 구토, 역류, 체중 감소, 식사 후 바로 구토, 가슴 통증 등이 발생할 수 있습니다. 특히 식도에 생긴 경우 음식 삼킴 후 즉각적인 구토나 흉부 압박감, 통증이 흔하고 위장관에 생기면 소화불량, 복통, 만성 구토 등이 나타날 수 있습니다. 증상 정도는 병변의 크기와 위치에 따라 다릅니다.