종합소득세 신고시 세무사와 금액 차이 나는 이유는 무엇인가요?

세무사 통해 4월에 신고를 마쳤고 예정 금액도 들었습니다.

지역 세무서에서 소득세 신고하라는 우편물이 와서

저도 모르게 우편물 절차대로 했는데

세무사에게 연락이 왔습니다.

신고한거 취소하라고요.

그제서야 보니까 금액 차이가 (소액이지만) 나더라고요.

차이가 얼마 안나면 굳이 수수료 안 떼고 이런 식으로 내가 해도 되지 않나 싶었습니다.

세무사에 원천징수영수증만 보냈는데 세무서와 세무사의 소득세 신고 금액이 차이 나는 이유가 무엇인가요?