고등어회가 시중에서 흔하지 않은 이유는 고등어의 신선도를 유지하기 어렵기 때문입니다. 고등어는 부패가 빠르고, 불포화지방산이 많아 공기와 접촉하면 산화가 빠르게 진행됩니다. 그래서 고등어는 잡은 후 바로 회로 먹거나 가까운 지역에서 신선도를 유지하면서 소비되어야 합니다. 또한, 고등어는 비린내가 강할 수 있어 다루기 어려운 점도 있습니다. 이러한 이유로 고등어회를 제공하는 횟집은 드물며, 주로 산지에서 바로 회로 먹을 수 있는 특수한 장소에서 제공됩니다.