토지 매매 때문에 문의합니다.

안녕하세요
시골 토지매매를 계약을 해서 잔금을 치루려고 합니다.
등기이전비용 때문에 문의드립니다.
토지가 2개로 나누어져 있는데 1필지는 223.0m2
2필지는 66.0m2 입니다.

법무사에서 등기이전비용계산서를 보내왔는데
2필지 매매금액이 41.000.000원인데
대금이 42.788.600으로 올랐습니다.
시가표준액을
(제1필지 33.093.200, 2필지9.695.400)이렇게 잡아놓았더라구요

부동산에 물어보니 공시가보다 낮은금액으로 거래해서 실거래가로 계산을 안하고, 공시가로 계산했다고 올랐다 합니다.
공시지가를 검색보았더니 제 1필지는 148.000원 2필지는 146.900원인데 공시지가는 보통 실거래보다 낮게 책정되어 있다고 들었는데 계산을 하니 가격이 안맞아서요
이경우는 무엇일까요? 올바르게 계산이 된게 맞는걸까요?
계산법도 알려주세요^^



법무사비용도 만만치 않네요 일단 비용은 드렸는데 불편한마음이 들어서요