구피 어항의 수질 오염을 늦추기 위해서는 화학적 여과재인 활성탄이나 제올라이트를 여과기에 추가하여 암모니아와 노폐물을 흡착하는 방법이 효과적이며 질산염 수치를 낮추는 액상 수질 정화제를 보조적으로 사용할 수 있습니다. 박테리아 활성제로는 니트로소모나스와 니트로박터 계열의 생박테리아제를 선택하여 여과 사이클을 안정시키는 것이 좋고 백점병 예방을 위해서는 수온을 일정하게 유지하는 히터 사용과 함께 메틸렌 블루 성분이 포함된 예방약을 정량 투여하는 것을 권장합니다. 다만 이러한 약품들은 보조적인 수단일 뿐 근본적인 수질 유지를 위해서는 주기적인 부분 환수가 필수적이며 기온이 오르는 여름철에는 냉각팬을 설치하여 수온 상승으로 인한 부패를 방지해야 합니다. 기성 제품 중에서는 네오 에이와 같은 박테리아제나 멜라픽스 계열의 천연 항균제를 상비약으로 구비하여 수질 악화 징후가 보일 때마다 지침에 맞춰 투여하십시오.