필로티 건물은 그 특성상 지진에 대한 취약점이 있지만, 적절한 내진설계를 통해 충분한 저항력을 갖출 수 있습니다. 내진설계 기준에 따라 필로티 건물과 일반 건물 모두 안전하게 설계될 수 있으며, 추가적인 보강 방법을 통해 필로티 구조의 단점을 보완할 수 있습니다. 따라서 내진설계가 제대로 적용되고, 건물의 구조적 보강이 충분히 이루어진다면 필로티 건물도 일반 건물과 동일한 수준의 지진 강도를 견딜 수 있습니다.
필로티 형식의 건축물은 2층 이상일 것이기 때문에 구조안전의 확인 대상 건축물이며, 구조안전의 확인시 내진설계가 포함됩니다. 내진설계가 없다고 가정하고 같은 규모에 하부 구조가 필로티 형식인 것과 아닌 것을 비교한다면 필로티 형식이 아닌 기둥과 벽이 다 있는 건축물이 더 안정적입니다. 기둥만 있는 것이 벽과 기둥이 함께 있는 것 보다 좌굴이 발생할 가능성이 높습니다. 하지만 필로티 형식의 경우 내진설계가 의무라 보시면 되기 때문에 지진에 견디는 것에는 문제가 없다고 봅니다. 추가로 필로티 형식이면서 3층 이상인 건축물는 구조기술사의 협력을 받아 설계해야 되는 대상입니다.