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은행 겉껍질 특유의 냄새는 주로 부티르산(Butyric acid)과 관련된 화학물질로 인해 발생합니다. 부티르산은 짧은 사슬 지방산으로, 공기 중으로 쉽게 휘발되어 강한 냄새를 발산합니다. 이 물질은 은행 겉껍질뿐만 아니라 부패한 버터, 구토 물질 및 땀에서도 찾아볼 수 있으며, 매우 낮은 농도에서도 인간의 후각을 자극할 수 있습니다.
은행 겉껍질에는 부티르산 외에도 다양한 황화합물이 포함되어 있어, 이 화합물들이 복합적으로 작용하여 은행 특유의 강한 냄새를 만들어냅니다. 황화합물은 특히 은행 겉껍질을 더욱 공격적인 냄새의 원인이 만듭니다.
또한, 은행에는 시안화물 화합물(cyanogenic compounds)이 포함되어 있어, 이것이 소량의 시안화수소(황산화수소 ; HCN)를 방출할 수 있습니다. 이러한 시안화물은 은행 씨앗에 주로 존재하며, 소화 과정 중에 분해되어 소량의 독성을 나타낼 수 있습니다. 그러나 은행 씨앗을 적절히 조리하면 이러한 독성 물질은 분해되어 안전하게 섭취할 수 있습니다.