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푸근한과학자
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식물의 광합성 효소인 루비스코에 대하여

루비스코는 이산화탄소를 고정하는 역할을 하는 효소로 광합성 과정에서 필수적이라고 알고 있습니다.

루비스코는 1초에 최대 10개 정도의 이산화탄소를 고정할 수 있다고 알고 있는데,

루비스코 등 효소가 낼 수 있는 속도가 한정되어 있는 이유가 궁금합니다.

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2개의 답변이 있어요!
  • 안녕하세요.

    루비스코(Rubisco, Ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase)는 광합성 과정에서 이산화탄소(CO₂)를 고정하는 데 필수적인 효소로, 지구에서 가장 풍부한 단백질 중 하나로 알려져 있습니다. 하지만 루비스코의 반응 속도는 상대적으로 느리며, 1초에 약 3~10개의 CO₂를 고정하는 데 그칩니다. 이러한 속도 제한은 효소의 구조적, 생화학적, 환경적 요인에 기인하며, 이는 효소 작용의 본질적 한계를 잘 보여줍니다.
    먼저, 루비스코의 구조적 제한이 중요한 요인으로 작용합니다. 루비스코는 복잡한 다중 단위체(multimeric enzyme)로, 활성 부위(active site)가 제한된 수만 존재합니다. 이 활성 부위는 CO₂와 Ribulose-1,5-bisphosphate(RuBP)라는 기질(substrate)과 결합하여 반응을 촉진하지만, 동시에 산소(O₂)와도 경쟁적으로 결합할 수 있습니다. 이러한 경쟁성은 효율을 떨어뜨리는 주요 원인이며, CO₂와 O₂가 활성 부위에 접근하기 위해 경쟁하기 위해 경쟁함에 따라 반응 속도가 느려지게 됩니다.
    또, 루비스코는 생화학적으로 상대적으로 낮은 촉매 효율을 가집니다. 촉매 전환율을 나타내는 kcat (1초당 효소가 촉매할 수 있는 반응 수)는 약 3~10으로, 이는 다른 효소들에 비해 매우 낮은 값입니다. 이는 루비스코가 반응 중간체(intermediate state) 형성에 시간이 많이 소요되기 때문이며, 반응의 다단계 과정과 복잡한 구조적 재배열이 속도를 제한합니다. 특히, CO₂를 고정하는 화학 반응은 활성화 에너지(activation energy)가 상대적으로 높아, 효소가 이를 촉매하기 위해 상당한 시간이 필요합니다.
    추가로, 환경적 요인이 루비스코의 작동 속도에 큰 영향을 미칩니다. 루비스코는 CO₂와 O₂의 상대적인 농도에 민감하며, 현재의 대기 조건에서는 CO₂ 농도가 낮고 O₂ 농도가 높기 때문에 효율이 더욱 떨어질 수 있습니다. 이러한 조건에서 루비스코는 CO₂ 대신 O₂를 더 자주 결합하여 광호흡(photorespiration)이라는 비효율적인 경로를 유발합니다. 광호흡은 에너지 소모가 크고 탄소 고정 효율이 낮아 광합성 전반의 생산성을 제한합니다.

  • 안녕하세요. 이충흔 전문가입니다.

    루비스코와 같은 효소의 반응 속도가 한정된 이유는 주로 구조적 및 생화학적 특성 때문입니다.루비스코는 이산화탄소뿐만 아니라 산소와도 결합할 수 있습니다. 이 두 기질 중 적합한 분자를 선택하는 과정에서 시간이 소요되어 반응 속도가 느려집니다.

    또한 루비스코는 이산화탄소 농도가 낮거나 산소 농도가 높을 때 산소를 더 자주 결합하게 되어 효율이 떨어집니다. 이는 광호흡으로 이어져 에너지 낭비를 초래합니다.

    루비스코는 복잡한 단백질 구조를 가지고 있어 반응을 촉매하는 활성 부위가 제한적이며, 한 번에 처리할 수 있는 기질의 양이 적습니다.

    결과적으로, 이러한 특성들이 루비스코의 속도를 제한하며, 이는 식물 광합성 효율에 영향을 미칩니다.