해파리는 바다물의 온도 상승, 먹이의 과잉 공급, 환경오염 등이 해파리 증식의 요인으로 볼 수 있습니다.
해파리가 환경이나 생태계에 미치는 영향은 광범위합니다. 해파리와 먹이를 공유하는 생물의 감소, 이로 인해 상위의 동물들도 감소하게 되어 해양 생태계의 불안정을 유발하고 어업 생산성을 저하할 수 있습니다.
일부 해파리의 경우 강한 독성을 가지고 있어서 쏘임 사고 등의 문제로 인체에 심각한 중독 증상을 유발할 수 있습니다.
국가 발전시설(원자력 수력 등)의 해수필터나 냉각장치가 해파리로 인해 막혀서 가동에 문제가 생길 수 있습니다.