일각에서 우려를 표하고 있는 GMO 사용으로 인한 인체에 대한 안전성 문제로는 첫째, 새로운 독성물질 생성 가능성, 둘째, 알레르기 유발 가능성, 셋째, 필수 영양성분의 변화 유발 가능성, 넷째, 항생제 내성 문제 유발 가능성, 다섯째, 유전자재조합 식품을 섭취했을 때 의 장기적 영향을 들 수 있습니다. 하지만 GMO의 인체 유해 가능성에 대한 여러 연구가 진행되고 있지만 아직은 이렇다 할 명확한 결과가 보고되지 않은 것이 사실입니다. 식품의약품안전처에서도 인체 건강에 대한 영향을 평가한 결과 GM 작물이 일반 작물에 비해 인체 건강에 더 큰 위험을 끼친다는 근거는 발견되지 않았다고 발표했습니다.