멜라닌 색소의 양과 분포가 다르기 때문입니다. 눈동자의 색은 홍채에 있는 멜라닌 색소의 양과 분포에 따라 결정됩니다. 멜라닌 색소가 많으면 갈색이나 검은색, 적으면 파란색이나 초록색등의 눈동자 색을 띠게 됩니다. 또한 유전적 요인도 있습니다. 눈동자 색은 유전적 요인에 의해 결정됩니다. 부모로부터 물려받은 유전자에 따라 홍채의 멜라닌 색소의 양과 분포가 다르기 때문입니다. 환경적 요인도 눈동자 색에 영향을 미칠 수 있습니다. 예를 들어 자외선 노출이 많은 지역에서는 홍채에 멜라닌 색소가 많이 생성되어 눈동자 색이 어두워 질 수 있습니다.