VNTR 반복 횟수 차이가 진화적 유연관계 분석에 어떻게 활용될 수 있나요?
안녕하세요. VNTR은 염기서열 자체는 같지만 반복 횟수가 달라지는데요, 이러한 반복 횟수 차이가 진화적 유연관계 분석에 어떻게 활용될 수 있는지 궁금합니다.
안녕하세요. 이상현 전문가입니다.
VNTR은 동일한 반복서열이 개체마다 반복횟수가 달라서 나타나게되는데,이 차이는 세대를거치면서 돌연변이율이 높아 빠르게 축적되게됩니다.
그래서 집단간에 VNTR패턴을 비교하면 같은 종내에 친연관계뿐아니라
가까운 종 간 진화적인 분화정도를 분자마커처럼 활용할수도 있습니다.
감사합니다.
VNTR은 특정 염기 서열이 반복되는 횟수의 차이를 이용해 진화적 유연관계를 분석하는 데 활용됩니다.
개체마다 VNTR 반복 횟수가 다르지만, 유전적으로 가까운 개체일수록 유사한 패턴을 보입니다. 이 패천은 비교적 돌연변이 발생률이 비교적 낮아, 공통 조상으로부터 물려받은 VNTR 패턴이 거의 변하지 않고 유지되기 때문입니다.
따라서, 여러 개체의 VNTR 반복 횟수 패턴을 비교하면 유전적 유사성을 파악할 수 있으며, 이를 통해 가계도를 추정하거나 집단 간의 유전적 거리를 분석할 수도 있습니다.
예를 들어 한 집단 내의 개체들이 특정 VNTR 패턴을 공유한다면, 이는 그들이 공통 조상을 가졌을 가능성이 높은 것이죠.
안녕하세요. 말씀해주신 것처럼 'VNTR(Variable Number Tandem Repeat)'은 반복되는 염기서열의 단위 자체는 동일하지만, 그 반복 횟수가 개체, 집단, 종에 따라 다르게 나타나는 특성을 가지고 있는데요, 이러한 특성을 가지고 있기 때문에 진화적 유연관계 분석에 활용할 수 있는 것입니다.
우선 반복 횟수 차이는 중립적 변이로 작용합니다. VNTR의 반복 횟수 변화는 보통 단순한 삽입/삭제 돌연변이에 의해 생기며, 이는 유전자의 기능과 크게 관련되지 않는 경우가 많은데요, 따라서 선택압보다는 무작위적인 돌연변이와 유전적 부동의 결과로 축적되며, 진화적 시간에 따라 개체군이나 종마다 서로 다른 패턴을 형성하게 됩니다.
두번째로는 개체·집단 간 유전적 거리 산출이 가능합니다. 특정 VNTR 자리에서 각 개체의 반복 횟수를 조사하면, 서로 다른 개체군 사이에 얼마나 많은 차이가 있는지를 정량화할 수 있는데요, 이러한 차이를 바탕으로 유전적 거리를 계산하고, 이를 통해 개체군 간 또는 종 간의 계통도를 그릴 수 있습니다.
세번째로는 근연종 간 변이 탐지에 유리합니다. VNTR은 짧은 시간 척도에서도 빠르게 변할 수 있기 때문에, 종 수준보다는 아종, 집단, 개체 수준의 관계 규명에 적합한데요, 예를 들어, 같은 종 내에서 집단 간 유전적 유사성, 분화 정도, 이주의 역사 등을 VNTR 데이터로 분석할 수 있습니다. 즉 VNTR의 반복 횟수 차이는 시간에 따라 무작위적으로 축적되는 변이이므로, 이를 여러 유전자 자리에서 비교하면 집단 간의 유전적 유연관계를 추론할 수 있는 것입니다. 감사합니다.
VNTR의 반복 횟수 차이는 유전적 다양성을 나타내는 지표로 활용됩니다. 각 개체는 특정 VNTR 영역에서 서로 다른 반복 횟수를 가지며, 이 차이를 분석하여 개체 간의 유전적 거리를 측정할 수 있습니다. 예를 들어, 반복 횟수 패턴이 비슷할수록 가까운 유전적 관계를, 패턴이 다를수록 먼 유전적 관계를 추정하는 데 사용됩니다. 이러한 분석은 친자 확인이나 집단 유전학 연구, 그리고 진화적 유연관계를 파악하는 데 유용하게 사용됩니다.
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