이국종 교수님은 의사를 그만두신 것이 아니며 여전히 의료 현장에서 종사하고 계십니다. 아주대학교병원 권역외상센터장에서 사임한 이후 국방부의 공모 절차를 거쳤습니다. 2023년 12월에 국군대전병원장으로 임명되어 해당 기관의 수장으로 취임하셨습니다. 국군대전병원장으로 임명되면서 신분이 민간인에서 군무원으로 변경되었습니다.그동안 군 의료 발전에 기여한 공로를 인정받아 명예해군 대령으로 진급하셨습니다. 현재 국군대전병원에서 군 장병들의 중증 외상 치료 및 응급 의료 체계를 총괄하고 계십니다. 의무 후송 헬기 운용과 응급 외상 진료 역량를 강화하는 등 군 의료 시스템 개선에 집중하고 계십니다.