707특수임무단과 13특수임무여단은 모두 대테러·특수작전을 수행하지만 임무 성격에는 차이가 있습니다. 일반적으로 707은 국가급 대테러, 인질구출, 항공기·시설 진압처럼 고난도 CQB(근접전투) 임무 비중이 큰 것으로 알려져 있습니다. 반면 13특임대는 후방 침투, 정찰, 요인 제거, 교란 작전 등 보다 광범위한 특수전 성격이 강조되는 편입니다. 실제 작전에서는 서로 협력하거나 임무가 겹치는 경우도 많아 외부에서 보면 비슷하게 느껴질 수 있습니다. 다만 구체적인 전술·편제·운용 방식은 군사 보안 사항이 많아 공개된 정보에는 한계가 있습니다.