메주에서 자주 발생하는 곰팡이는 보통 Aspergillus 속의 곰팡이로, 주로 메주가 자연적으로 발효되면서 생깁니다. 이 곰팡이는 메주의 발효 과정에서 중요한 역할을 하며, 일반적으로는 몸에 해롭지 않지만, 만약 지나치게 많이 자라거나 관리가 제대로 되지 않으면 아플라톡신 같은 유해 물질이 생성될 수 있습니다. 아플라톡신은 간에 해를 끼칠 수 있기 때문에, 메주를 만들고 저장할 때는 곰팡이가 적당히 자라도록 관리하고, 과도한 곰팡이가 자라지 않도록 주의하는 것이 중요합니다.