실리콘에 생긴 검은 곰팡이는 표면에만 있는 것이 아니라 실리콘 내부까지 균사가 침투한 경우가 많아서, 일반 세제로 닦아서는 잘 없어지지 않습니다.
가장 효과적인 방법은 곰팡이 제거제나 락스 계열 제품을 키친타월에 충분히 적신 뒤 곰팡이 부위에 밀착시켜 2시간에서 12시간 정도 두는 것입니다. 이후 물로 닦아내면 표면 곰팡이는 상당 부분 제거될 수 있습니다.
다만 이미 검은색이 실리콘 안까지 착색된 경우에는 곰팡이가 죽더라도 검은 자국은 남을 수 있습니다. 이런 경우에는 청소만으로 완전히 하얗게 복구되기 어렵습니다.
실리콘을 새로 덧바르는 것은 권장되지 않습니다. 기존 곰팡이 위에 덧바르면 접착력이 떨어지고 내부 곰팡이가 계속 증식할 수 있습니다. 가장 좋은 방법은 기존 실리콘을 제거한 후 새로 시공하는 것입니다.