과학고 학생들은 보통 상위권 대학 진학 목표가 큰 편이고 국내에서는 의대와 카이스트, 포스텍, 서울대학교 같은 이공계 진학을 많이 생각합니다. 물론 해외 대학, 특히 미국 명문대 준비하는 학생들도 일부 있지만 전체가 다 그런건 아닙니다. 연구,공학,수학 분야에 관심이 큰 학생들이 많아서 '어디가 제일 유명하냐'보다 자기 분야을 더 중요하게 보는 경우도 많습니다.
과학고등학교는 수학과 과학이 정말 뛰어난 학생들이 가는 특목고라서 중학교 상위 5%보다는 훨씬 더 잘해야 들어갈 수 있다고 봐야 합니다. 실제 전교 1등도 떨어지는 경우가 많아요. 그리고 과학고 진학 후 고2를 마치고 조기 졸업을 하면 카이스트로 진학을 하고 3년을 다 마친 경우 소위 말하는 SKY 혹은 해외 명문대로 진학을 하는 경우가 많습니다.