플루오로퀴놀론계 항생제를 제산제, 칼슘제, 철분제 등과 병용 시 킬레이트가 형성되기 때문에 장 점막을 통과하지 못하고 그대로 배설되므로 결과적으로 흡수율이 떨어지게 됩니다. 참고로 테트라사이클린계 항생제도 같은 원리로 제산제, 칼슘제, 철분제와 병용 시 흡수율이 떨어집니다.
항생제로서의 치료 농도에 도달하기 위해서는 항생제 먼저 복용하고 2시간 뒤에 영양제 혹은 제산제를 먹거나, 영양제/제산제를 먼저 복용하고 4시간 뒤에 항생제를 복용하면 됩니다.
플로로퀴놀론계 항생제는 미네랄과 킬레이트 복합체를 형성합니다. 킬레이트 복합체는 물에 잘 녹지 않는 거대한 불용성 물질이 됩니다. 소장 점막 세포의 흡수 채널을 통과하기에는 분자 크기가 지나치게 커지기 때문에, 항생제가 혈액 내로 흡수되지 못하고 장관 내에 머물다가 대변으로 그대로 배출됩니다. 그래서 항생제가 흡수되지 않고 배설되기 때문에 약효가 떨어집니다.