염색체를 염색하고 현미경으로 관찰했을 때 밴드는 진하게 염색되고 인터밴드는 상대적으로 연하게 염색됩니다. 여기서 말하는 밴드라는 것은 DNA가 조밀하게 묶여있는 부분을 말하는 것으로 특정 유전자가 휴면 상태에 있는 영역을 말합니다. 또 인터밴드는 DNA가 덜 조밀하고 보통 활발히 전사가 일어나는 유전자가 위치하는 영역입니다.
초파리와 같은 쌍시류 곤충의 유충에서 볼 수 있는 침샘염색체는 보통 세포에 비하여 길이와 폭이 100배 정도 더 크고 염색체 상의 여러 무늬를 확인하기 쉬운데요, 초파리의 침샘염색체에는 약 5000여 개의 크고 작은 띠가 관찰되며 이는 유전자들의 염색체 상의 위치를 결정하는데 중요한 기준이라고 할 수 있습니다. 즉 침샘염색체에 나타나는 다수의 가로줄 band는 유전자가 있는 위치를 파악할 수 있으며, 진하게 염색되는 부분은 DNA가 매우 응축된 부분이고 상대적으로 연하게 염색되는 부분은 DNA가 덜 응축된 부분입니다.