대장내시경을 준비하는 과정에서 변을 너무 자주 보아 항문이 따갑고 쓰라린 상황이시군요. 항문이 너무 많은 자극을 받아 나타나는 증상일테니 항문에 보습제를 발라 보호해주실 수 있겠습니다. 비판텐 연고나 바세린을 발라보시고, 약국에서 파는 치질연고 중 항문의 통증을 줄여줄 수 있는 종류가 있으니 잠시 사용해보셔도 좋습니다. 변이 잦아들고 시간이 지나면 회복될 수 있을 것이나, 내시경 이후에도 불편감이나 통증이 지속되면 항문외과를 추가로 방문해보시기 바랍니다.
저의 답변이 부족하겠지만 조금이나마 도움이 되셨길 바랍니다. (본 답변은 진료를 대신할 수 없습니다.)