개인사업자, 법인 세무, 회계 궁금점

특이한 영업건이 생겨서 운영이 독특하게 진행되는데 세무나 회계적으로 문제될 사안이 있는지 궁금합니다
아래의 업체 중 D의 세무나 회계에 대한 내용 입니다

A - 제조사 / 한국
B - 수입자 / 해외
C - 물류사 / 한국
D - 정산업체 / 한국
E - B의 에이전트 / 해외

D와 E는 커미션 지급 구조 - 한국 방문이나 출장간 현금 지긍
커미션 계약은 서류 구비

한국 계산서 발급 형태, 금액은 예시
C > D 물류비 100만 발행
D > A 물류비 150만 발행
D > E 커미션 분배 30만 현금 지급 20만은 D업체 수익

물품 대금은 B > A 로 지급
위 경우 D 업체의 증빙서류나 세금이 어떻게 책정될까요?
D는 개인사업자 기준입니다