일부 고사리 종류에는 독성이 있을 수 있는 것으로 알려져 있습니다. 특히 가시고사리(참고사리)라고도 불리는 일부 고사리는 적당한 가열 처리 또는 삶음을 하지 않으면 독성을 가질 수 있습니다.
고사리에는 게르마놀라이드(Germa-nolides)라는 화합물이 포함되어 있을 수 있습니다. 이 화합물은 소화 효소를 억제하여 소화 기관에 자극을 줄 수 있습니다. 따라서 적절한 가열 처리나 삶음을 통해 독성을 제거하는 것이 중요합니다. 고사리를 조리할 때는 충분한 시간과 온도로 완전히 익혀야 합니다.