영양적인 관점에서 볼 때, 간헐적 단식은 식사 시간을 제한하여 공복 상태를 유지함으로써 우리 몸이 저장된 에너지를 사용하도록 유도합니다. 이때 우리 몸은 우선적으로 글리코겐을 소모한 후, 주된 에너지원으로 체지방을 사용하게 됩니다. 따라서 적절하게 이루어지는 간헐적 단식은 일반적으로 근육량보다는 체지방 감소에 더 효과적입니다. 근육은 우리 몸의 중요한 기능을 담당하기 때문에, 우리 몸은 에너지가 부족한 상황에서도 근육을 최대한 보존하려는 경향이 있습니다. 물론 극심하거나 장기간의 단식, 또는 단식 기간 외에 단백질 섭취가 충분하지 않거나 근력 운동을 병행하지 않으면 근육 손실이 발생할 수도 있습니다. 하지만 보통의 간헐적 단식 방법으로는 에너지원으로 저장된 체지방을 우선적으로 사용하게 되는 것입니다. 물론, 체중 감량 과정에서 근육량이 일부 감소할 수도 있지만, 건강한 체중 감량과 잘 계획된 간헐적 단식의 목표로는 근육량 감소를 최소화하면서 체지방을 줄이는 것입니다.