질문자님 사업장의 취업규칙(사규)를 기준으로 법 보다 근로자에게 불이익하게 해석하여 연차휴가를 삭감하여 미사용 수당을 지급한다면 근로기준법 위반에 해당하므로 관할 노동지청에 진정을 제기하실 수 있습니다.
근로자가 일단 연차유급휴가권을 취득한 후에 연차유급휴가를 사용하기 전에 퇴직 등의 사유로 근로관계가 종료된 경우, 근로관계의 존속을 전제로 하는 연차휴가를 사용할 권리는 소멸한다 할지라도 근로관계의 존속을 전제로 하지 않는 연차휴가수당을 청구할 권리는 그대로 잔존하는 것이어서, 근로자는 근로관계 종료시까지 사용하지 못한 연차휴가일수 전부에 상응하는 연차휴가수당을 사용자에게 청구할 수 있습니다. (대법2003다48549, 2005.5.27. 선고 )